Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRR4Q16378 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRR4Q16378 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms