Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCGQ13326 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCGQ13326 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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