Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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RABGGTBP53611 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RABGGTBP53611 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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RABGGTBP53611 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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RABGGTBP53611 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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RABGGTBP53611 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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RABGGTBP53611 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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RABGGTBP53611 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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RABGGTBP53611 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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RABGGTBP53611 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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RABGGTBP53611 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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RABGGTBP53611 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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RABGGTBP53611 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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