Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DFFAO00273 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DFFAO00273 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DFFAO00273 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DFFAO00273 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DFFAO00273 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
DFFAO00273 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DFFAO00273 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DFFAO00273 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DFFAO00273 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DFFAO00273 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DFFAO00273 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DFFAO00273 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
DFFAO00273 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
DFFAO00273 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
DFFAO00273 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DFFAO00273 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DFFAO00273 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DFFAO00273 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DFFAO00273 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DFFAO00273 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DFFAO00273 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DFFAO00273 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DFFAO00273 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DFFAO00273 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DFFAO00273 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DFFAO00273 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DFFAO00273 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DFFAO00273 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DFFAO00273 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DFFAO00273 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
DFFAO00273 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DFFAO00273 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DFFAO00273 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DFFAO00273 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
DFFAO00273 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DFFAO00273 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DFFAO00273 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DFFAO00273 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DFFAO00273 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DFFAO00273 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DFFAO00273 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DFFAO00273 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DFFAO00273 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DFFAO00273 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DFFAO00273 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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