Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Q1T7F1 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Q1T7F1 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Q1T7F1 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Q1T7F1 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Q1T7F1 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Q1T7F1 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Q1T7F1 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
Q1T7F1 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Q1T7F1 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Q1T7F1 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.6 ms