Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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PTPRKQ15262 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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PTPRKQ15262 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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PTPRKQ15262 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
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PTPRKQ15262 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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PTPRKQ15262 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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PTPRKQ15262 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
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PTPRKQ15262 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRKQ15262 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRKQ15262 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRKQ15262 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRKQ15262 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRKQ15262 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRKQ15262 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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