Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms