Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
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GTF3C6Q969F1 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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GTF3C6Q969F1 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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GTF3C6Q969F1 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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GTF3C6Q969F1 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C6Q969F1 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C6Q969F1 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C6Q969F1 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C6Q969F1 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C6Q969F1 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C6Q969F1 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C6Q969F1 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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