Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PUM3Q15397 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PUM3Q15397 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms