Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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APOFQ13790 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
APOFQ13790 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
APOFQ13790 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
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APOFQ13790 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
APOFQ13790 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
APOFQ13790 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
APOFQ13790 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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APOFQ13790 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
APOFQ13790 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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APOFQ13790 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
APOFQ13790 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
APOFQ13790 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
APOFQ13790 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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APOFQ13790 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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APOFQ13790 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
APOFQ13790 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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APOFQ13790 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
APOFQ13790 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
APOFQ13790 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
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APOFQ13790 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
APOFQ13790 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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APOFQ13790 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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APOFQ13790 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
APOFQ13790 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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APOFQ13790 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
APOFQ13790 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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APOFQ13790 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
APOFQ13790 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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APOFQ13790 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
APOFQ13790 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
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