Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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HOXD10P28358 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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