Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SSX1Q16384 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SSX1Q16384 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SSX1Q16384 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SSX1Q16384 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SSX1Q16384 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SSX1Q16384 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SSX1Q16384 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SSX1Q16384 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SSX1Q16384 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SSX1Q16384 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.38
SSX1Q16384 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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