Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3238W4VSP7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms