Protein–RNA interactions for Protein: V9GXR0

H2-Bl, Histocompatibility 2, blastocyst, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-BlV9GXR0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms