Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms