Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms