Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Hdac6Q9Z2V5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Hdac6Q9Z2V5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac6Q9Z2V5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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