Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms