Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ilf3Q9Z1X4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms