Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccl27Q9Z1X0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccl27Q9Z1X0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccl27Q9Z1X0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl27Q9Z1X0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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