Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms