Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J3

Nfs1, Cysteine desulfurase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfs1Q9Z1J3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfs1Q9Z1J3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfs1Q9Z1J3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms