Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Skp2Q9Z0Z3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms