Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib1Q9Z0F4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms