Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme3Q9WV85 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms