Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms