Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn8aQ9WTU3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms