Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms