Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv2Q9WTR1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpv2Q9WTR1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms