Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcm1Q9R0L6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms