Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms