Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmfrQ9R049 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms