Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Rnf4Q9QZS2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Rnf4Q9QZS2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Rnf4Q9QZS2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rnf4Q9QZS2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rnf4Q9QZS2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rnf4Q9QZS2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rnf4Q9QZS2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rnf4Q9QZS2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rnf4Q9QZS2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rnf4Q9QZS2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rnf4Q9QZS2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rnf4Q9QZS2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rnf4Q9QZS2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms