Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col4a3Q9QZS0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a3Q9QZS0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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