Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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