Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc3Q9QZC1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms