Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt3Q9QZ47 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms