Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms