Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxe3Q9QY14 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms