Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk1nQ9QXV0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk1nQ9QXV0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms