Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms