Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms