Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms