Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gde1Q9JL56 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms