Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms