Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms