Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mrpl39Q9JKF7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mrpl39Q9JKF7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mrpl39Q9JKF7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mrpl39Q9JKF7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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