Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms