Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms