Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms